どちらの部活も、高校から入る人はそれなりにいると聞いています。年によってバラツキはあると思いますが、少なくはないです。
私の友人が初心者で吹奏楽部に入りましたが、高校から入る人は初心者が多いらしく、全くそのような心配はいらないと思います。
クワイヤーについては分かりませんが、恐らく心配ないでしょう。
活動日についてですが吹奏楽部はかなりハードだと思います。運動部のように日曜以外は練習、時間も6時ぐらいまでやっているようです。また、夏には合宿もあり、一日中楽器を吹いている感じです。
それに対してクワイヤーは少し楽かなといった印象です。ただ、クリスマスには夜遅のコンサートをやったり、礼拝に参加したりといったことがあり、行事が多いなと個人的に感じています。
クワイヤーのコンサートはYouTubeで見ることができます。
https://youtu.be/O9AGaPfYS3A親の出番ですが、ほとんどないと思います。東京、埼玉、千葉、神奈川など遠くから来ている生徒もいますし、あまりお願いすることもないと思います。
練習は大変かもしれませんが、個人的にはどちらもやる気があれば充実したものとなると思います。大学付属ですし、部活に打ち込めると思います。
ちなみに私は他の文化部でのんびりやっています。ガツガツしていない部活の方が自分の時間に余裕が持てて、自分の趣味に時間を使うことができています。
参考になれば幸いです。