変わります。上位の方が当然発展的な問題も授業で解くことになりますし、購入する教材が違う場合もあります。あと、2年生の上位は強制的に第一志望が名大以上になります。志望してなくても
模試にはそう書かされます。
私は下位の人間でした、下位はギリギリ上位から漏れた人とちょっと…って人が混ざっているため、かなり学力差が露骨な状態になり、授業の進行が遅れがちになります。ちゃんと勉強してたのに下位に配属されると色々不満も出るでしょうね。
上位、特に3年生の上位は大変だそうです。私の時は補習も他のクラスより長く19時まで目一杯やってました。一部実考も上位と下位で全く違う内容となっており、下位とは離れた世界です。
ただ、別に下位に配属されたからと言って進学出来ないとかは全然ありません。下位でもちゃんと勉強している人もいて、2、3年生共に下位の人が上位の人の成績を上回るなんてことはざらにあります。
私も国公立に受かりましたし、仮に下位になっても進学面で絶望することはないです。
余談ですが、上位下位という表現は五条生の間では一般化していますが、教師陣はこの言い方を嫌っています。教師に聞かれると怒られることもあるので、教師の前では応用(上位)標準(下位)で表現した方がいいですよ。