Gコースから理系は厳しいと思います。
理由として、理系科目はほぼ履修出来ないためです。選択2で
数学Bを選択できますが、数3、物理、化学、生物(基礎なし)は2、3年時Gコースでは履修できません。(Gコースの選択2の生物は今年度1年生の代から廃止されたようです。)Gコースは一応文系という括りになっています。国公立大学の理系の受験科目は数3と物理、化学、生物(基礎なし)であることが多いです。勿論、探せば受験しなくても良い大学もあるかもしれませんが、やはり理系大学でやっていく以上…と考えるとGコースからの国公立大学で理系は厳しいものがあります。
根本的に、苦言を呈すならばGコースで国公立大学を目指すことは、とても苦労を強いる事になります。GコースとYコースでは教材や出される課題も違うことがありますし、確実に入試に向けて力をつけたいのならYコースに入るべきです。Gコースでももちろん頑張り次第では国公立大学に受かると思いますが…。もしGコースで国公立大学を狙うのなら、補習等を積極的に受講したり、個人で努力することが大事になってくると思います。自分の進路に向けて頑張ってください^^*