理系の方が平均点が高い傾向があります。医学部志望で推薦を狙っている子が毎年一定数いて、定期試験も頑張る人が多いためです。指定校狙いなら文系の方が取りやすいとは思いますが、将来やりたいことを優先した方が良いと思います。歴史が苦手なら文系はキツいかもしれません。文系に進まれるにしても
数学は1年生の時に頑張っておくと、文系は
数学が苦手な人が多いので高い評定を取りやすくなります。
私立大学の指定校推薦では落ちることはありません。試験もありません。
国公立大には指定校推薦なるものはなく、単に学校推薦という一般公募推薦でさらに条件が厳しくなったものだけです。この場合学校推薦と言っても倍率は2倍以上はあります。試験や論文、
面接などで評価されるので合格するのはなかなか厳しいです。
また成績は文系と理系ごとに別々相対評価でつけられますので、平均値の低い文系の方が成績は相対的に高くつくことになるので、評定平均値を上げやすいということです。
でも東高にくる文系の指定校は慶應が1名、早稲田が2名、同志社が1名ぐらいで人数が少ないので、あまり指定校狙いというのはお勧めできません。