英語が得意なんですね！！
理社は夏休みに詰め込んだらまだまだ間に合うと思います。
特に社会は伸び代あると思うので頑張って下さい！
内申は私も中2の時40なかったので中3で挽回すれば大丈夫です。
後は塾のテストの判定を見て苦手な所を潰せるように頑張って下さい。
古文単語を早めに覚えておくことをお勧めします！
40ないのは不安。中3では44欲しいです。当日点で内申のカバーをするのは危険です。予想テストで理社は何点とれていますか？
過去問なら150/180を目指してください。
社会は一問一答で基礎をしっかり。1周では足りないので最低3周はしてください。全て漢字でかけるようにする。(墾田永年私財法など、あやふやなものを自信をもってかけるように)
地名がでたらその場所を地図で逐一確認してください。(シラス台地、日本アルプス、長安、日米和親条約･日米修好通商条約で開港した場所それぞれ、ヨーロッパ諸国など。今年の入試では藤岡京の場所が出ました)こういう勉強の仕方でテストのやり直しをすれば良いですよ。自分の間違えた問題をノートにまとめるのも良いです。(地図の場所もメモして！)テスト時間の倍以上の時間をやり直しに費やしてください。点数に一喜一憂する暇があるならやり直ししまくってください。定期テストでも同じことが言えます。
理科は１、２問難しい計算問題があると思います。難問に時間を使うのではなく、自分のできる問題を完璧に合わせるための見直しに時間を使うこと。難問は解説を見て、類題も解けるようにやり直しをすれば良いですね。基本問題をして、一問でもミスるようならyoutubeで勉強し直してください。(とある男が授業してみた など)確認問題→基礎→発展。基礎は全分野完璧にできるように！！
塾の先生に質問しまくってくださいね！！
